有机肥原材料在发酵前需要进行预处理，预处理的设备包括以下几种：
1、固液分离机（畜禽粪便脱水机）部分养殖场的粪便，由于含水量过大，根本没法直接利用。需要用固液分离机将粪便脱水后，进行发酵处理，。主机(脱水机)电机功率5.5千瓦(带减速机)，吸浆泵电机功率4千瓦。每小时处理混合液:20方，鸡粪固形物15，得挤压后鸡粪6方，牛粪固形物40，得牛粪8方。含电机、水管、泵、脱水机、电控机，价格一般在3万元以内。
有机肥料的生产是一个废物利用的过程，固液分离机一般含有挤压主电机和液下输送电机，处理量较大的固液分离机每小时耗电10千瓦左右。为发酵原料投入了些许能耗、人工和设备维护成本，这就是固液分离机没有大量普及的根本原因。由于液态粪便利用价值相对不大，加之需要消耗一些电能(300毫米挤压仓直径的固液分离机每小时耗电理论9千瓦)，因此，很多企业购置此项设备后，有时并未使用。
2、真空抽粪车， 以农作物秸秆等粗纤维类原料为主料发酵制作有机肥料时。需要在其上加入粗蛋白营养成分。此时，可用真空抽粪车将含水量较高的人畜粪便抽入车内，释放到主料中，以增加有机肥料或者育苗基质的养分含量，促进粗纤维快速腐烂。价格一般2--4万元。
3、铲车和机动运输车，粪便等适宜生产生态有机肥料的原料产生后，需要机动车辆将直接发酵或者可以调配发酵的原料运输到发酵场所进行发酵处理。用铲车装载发酵原料速度较快，一般几铲就可以装一车，装车后，由运输车将原料直接运往发酵场地。如果发酵原料和发酵场地在一起，机动车就可以不用，直接用铲车堆成条垛，加入菌种发酵了。
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